数据集概述
本数据集为切萨皮克湾钻纹龟基因流动时空分析研究的配套数据,包含617个个体(来自15个地点)的12个多态微卫星位点遗传数据,涉及种群结构、基因多样性、有效种群大小及基因流动时间变化等分析内容,共10个文件。
文件详解
- 原始数据文件
- 文件名称:TerpRawData.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:钻纹龟基因分析的原始数据记录
- 长度数据文件
- 文件名称:TerpLen.len
- 文件格式:.len
- 字段映射介绍:钻纹龟相关长度数据记录
- 迁移矩阵文件
- 文件名称:BA3-MigrateMatrix.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:基因迁移矩阵数据
- R代码文件
- 文件名称:get_modes.r
- 文件格式:.r
- 字段映射介绍:用于获取模式的R语言代码文件
- 贝叶斯分析文件
- 文件名称:TerpBayesass.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:贝叶斯分析相关文本数据
- 结构分析文件
- 文件名称:TerpStructure.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:种群结构分析文本数据
- GenePop格式文件
- 文件名称:TerpGenePop.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:GenePop软件格式的基因数据
- SST格式文件
- 文件名称:TerpSST.sst
- 文件格式:.sst
- 字段映射介绍:SST格式的基因数据文件
- Migrate分析文件
- 文件名称:TerpMigrate-n.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:Migrate软件分析的基因数据,包含种群编号、个体数据等信息
- 先验文件
- 文件名称:MuPriors.prs
- 文件格式:.prs
- 字段映射介绍:先验参数相关文件
数据来源
论文“Spatiotemporal analysis of gene flow in Chesapeake Bay Diamondback Terrapins (Malaclemys terrapin)”
适用场景
- 生物遗传学研究: 分析钻纹龟种群基因流动的时空变化规律
- 种群生态学研究: 探究人类活动对钻纹龟种群连通性的影响
- 保护生物学研究: 为钻纹龟保护目标设定提供基因层面的数据支持
- 基因数据分析方法验证: 测试基因流动分析相关软件(如Migrate、BayesAss)的应用效果
- 历史生态过程研究: 揭示二十世纪初 translocation 事件对当代基因流动的长期影响