Chesapeake_Based_切萨皮克湾钻纹龟基因流动时空分析数据集

数据集概述

本数据集为切萨皮克湾钻纹龟基因流动时空分析研究的配套数据,包含617个个体(来自15个地点)的12个多态微卫星位点遗传数据,涉及种群结构、基因多样性、有效种群大小及基因流动时间变化等分析内容,共10个文件。

文件详解

  • 原始数据文件
  • 文件名称:TerpRawData.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:钻纹龟基因分析的原始数据记录
  • 长度数据文件
  • 文件名称:TerpLen.len
  • 文件格式:.len
  • 字段映射介绍:钻纹龟相关长度数据记录
  • 迁移矩阵文件
  • 文件名称:BA3-MigrateMatrix.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:基因迁移矩阵数据
  • R代码文件
  • 文件名称:get_modes.r
  • 文件格式:.r
  • 字段映射介绍:用于获取模式的R语言代码文件
  • 贝叶斯分析文件
  • 文件名称:TerpBayesass.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:贝叶斯分析相关文本数据
  • 结构分析文件
  • 文件名称:TerpStructure.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:种群结构分析文本数据
  • GenePop格式文件
  • 文件名称:TerpGenePop.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:GenePop软件格式的基因数据
  • SST格式文件
  • 文件名称:TerpSST.sst
  • 文件格式:.sst
  • 字段映射介绍:SST格式的基因数据文件
  • Migrate分析文件
  • 文件名称:TerpMigrate-n.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:Migrate软件分析的基因数据,包含种群编号、个体数据等信息
  • 先验文件
  • 文件名称:MuPriors.prs
  • 文件格式:.prs
  • 字段映射介绍:先验参数相关文件

数据来源

论文“Spatiotemporal analysis of gene flow in Chesapeake Bay Diamondback Terrapins (Malaclemys terrapin)”

适用场景

  • 生物遗传学研究: 分析钻纹龟种群基因流动的时空变化规律
  • 种群生态学研究: 探究人类活动对钻纹龟种群连通性的影响
  • 保护生物学研究: 为钻纹龟保护目标设定提供基因层面的数据支持
  • 基因数据分析方法验证: 测试基因流动分析相关软件(如Migrate、BayesAss)的应用效果
  • 历史生态过程研究: 揭示二十世纪初 translocation 事件对当代基因流动的长期影响
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.52 MiB
最后更新 2026年1月22日
创建于 2026年1月22日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。