数据集概述
本数据集包含葡萄牙国家卫生研究所性传播感染国家参考实验室开展的沙眼衣原体抗生素耐药性研究的测序数据,主要涵盖23S rRNA大环内酯耐药区域及gyrA QRDR序列,用于分析临床菌株的耐药基因标记及基因组背景,共包含3个文件。
文件详解
- 补充表格文件
- 文件名称:
Supplementary table 1_ZENODO support.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:作为研究的补充表格,推测包含临床样本基本信息、测序样本对应关系或耐药性分析相关的辅助数据(具体字段未提供预览)
- 23S rRNA序列比对文件
- 文件名称:
align_Sanger_vs_NGS_23SRNA.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含沙眼衣原体23S rRNA大环内酯耐药区域的Sanger测序与NGS测序比对序列数据
- gyrA QRDR序列比对文件
- 文件名称:
align_Sanger_vs_NGS_gyrA_QRDR.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含沙眼衣原体gyrA基因QRDR区域的Sanger测序与NGS测序比对序列数据
数据来源
葡萄牙国家卫生研究所(INSA)性传播感染国家参考实验室(NRL)
适用场景
- 病原体耐药性机制研究: 分析沙眼衣原体23S rRNA及gyrA基因区域的耐药相关突变位点
- 临床耐药性检测应用: 基于测序数据开发或验证沙眼衣原体抗生素耐药性的分子检测方法
- 基因组测序技术比较: 对比Sanger与NGS技术在耐药基因区域测序中的准确性与一致性
- 区域耐药性流行病学分析: 结合葡萄牙临床菌株数据,研究当地沙眼衣原体耐药性流行特征