数据集概述
本数据集为斑翅草蝗（Chorthippus biguttulus）全生命周期7个发育阶段的转录组数据，涵盖胚胎发育至成虫阶段。通过转录组测序揭示不同发育阶段的差异基因表达模式，涉及信号传导、细胞分化、器官发育等关键生物学过程，为直翅目昆虫发育研究提供基础数据。
文件详解
- all6_larval.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：包含6个若虫阶段的转录本序列信息
- larval_and_erl_adults.counts.matrix
- 文件格式：MATRIX
- 字段映射介绍：若虫及成虫阶段的基因表达计数矩阵
- sample_IDs.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：样本ID信息表，记录不同发育阶段样本的标识及对应关系
- all6_larva_fpkm0.1_minLen600.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：筛选后的若虫阶段转录本序列（FPKM≥0.1且长度≥600bp）
数据来源
论文“Transcriptome profiling of ontogeny in the acridid grasshopper Chorthippus biguttulus”
适用场景
- 昆虫发育生物学研究：分析斑翅草蝗不同发育阶段的基因表达动态，探究胚胎发育、若虫蜕壳及成虫羽化的分子机制
- 直翅目昆虫进化研究：对比不同发育阶段的转录组差异，揭示半变态昆虫发育的进化特征
- 基因功能注释：通过转录本序列挖掘参与发育调控的关键基因，如信号通路、细胞分化相关基因
- 农业害虫防治研究：解析斑翅草蝗发育关键基因，为开发靶向性害虫防控技术提供靶点
- 昆虫免疫与衰老机制研究：分析成虫阶段上调基因的功能，探究昆虫免疫应答与衰老的分子基础
