数据集概述
本数据集为大西洋鳕鱼繁殖成功研究的基因组数据,支持分析选择性繁殖对种群遗传多样性的影响。包含样本ID文件、基因组分析输出压缩包及说明文档,共7个文件。用于验证高繁殖力生物的繁殖动力学模型,揭示选择性繁殖在种群遗传中的作用。
文件详解
- 说明文档
- 文件名称:README.md
- 文件格式:MD
- 字段映射介绍:数据集标题、内容摘要、实验背景及结果说明,含bwa-mem比对的bam文件信息及位点频率谱数据引用(DOI:10.7554/eLife.80781、10.1101/2022.05.29.493887)
- 样本ID文件
- 文件名称:sampleID_thistilfjordur.txt、sampleID_south_souteast.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含大西洋鳕鱼样本编号列表(如122855Ice、122858Ice等)
- 基因组分析输出压缩包
- 文件名称:Gmaout-gl1.zip、Gmaout-gl2.zip、IceThi2_Gmaout-gl1.zip、IceThi2_Gmaout-gl2.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:基因组分析结果压缩包,含bwa-mem比对生成的bam文件及位点频率谱数据
数据来源
论文“Sweepstakes reproductive success via pervasive and recurrent selective sweeps”
适用场景
- 进化基因组学研究: 分析高繁殖力生物(如大西洋鳕鱼)的繁殖动力学与遗传多样性关系
- 种群遗传学分析: 验证选择性繁殖对种群遗传结构的影响,支持渔业资源管理
- 基因组数据建模: 利用位点频率谱数据构建高繁殖力生物的进化模型
- 生物繁殖机制研究: 探索选择性繁殖在种群适应和 resilience 中的作用