数据集概述
本数据集聚焦澳大利亚圣诞岛近期减少的蜥蜴动物群(4种),研究其岛屿生物地理起源与高系统发育独特性。包含系统发育分析相关的基因序列文件、XML格式的系统发育模型文件及补充文档,涉及圣诞岛蜥蜴与周边区域物种的亲缘关系、分化时间等核心内容,共11个文件。
文件详解
- 系统发育模型文件(.xml格式,共6个)
- 文件名称:Crypt_strict_Yule.xml、Lep.nucgenes.3p.lgnm.BD.xml、Lep.3g.6p.strict.BD.xml、Cyrt.lgnm.Yule.3p.xml、Emoia_strict_Yule.xml、Cyrt.lgnm.BD.no3rdtRNA.xml
- 内容说明:存储系统发育分析所用的模型参数,包括Yule模型、BD( birth-death)模型等不同进化模型的配置信息
- 基因序列文件(.txt格式,共4个)
- 文件名称:Emoia_ND2.txt、Lepidodactylus_ND2_RAG_PHOS.txt、Cyrtodactylus ND2_RAG_PHOS.txt、Cryptoblepharus_ND2.txt
- 内容说明:以NEXUS格式存储蜥蜴物种的基因序列数据,包含ND2、RAG、PHOS等基因片段,涉及多个物种的分类单元标签(如Gehyra_mutilata_LSHC、Gekko_athymus_KU309335等)
- 补充文档(.docx格式,1个)
- 文件名称:Oliver 2017 Supplementary file.docx
- 内容说明:研究相关的补充材料文档
数据来源
论文“Insular biogeographic origins and high phylogenetic distinctiveness for a recently depleted lizard fauna from Christmas Island, Australia”
适用场景
- 岛屿生物地理学研究:分析圣诞岛蜥蜴动物群的起源与扩散路径,探讨华莱士线对物种分布的屏障作用
- 系统发育独特性评估:基于基因序列与系统发育模型,量化圣诞岛蜥蜴物种的系统发育分化程度
- 生物多样性保护:结合物种近期减少现状,为圣诞岛濒危蜥蜴的保护优先级制定提供系统发育依据
- 进化模型验证:通过不同XML模型文件,比较Yule、BD等进化模型在岛屿蜥蜴类群中的适用性
- 生物地理屏障分析:探究环境与生物因素如何阻碍圣诞岛蜥蜴类群在巽他陆架大陆区域的多样化