数据集概述
本数据集包含澳大利亚半干旱地区Cinclosoma属鸟类的多基因序列数据及相关分析文件,涉及栗胸鹑鸫和铜背鹑鸫两个近缘物种。数据记录了物种分布、种群历史动态及基因流情况,用于研究更新世气候波动对非冰川区物种分化的影响,共6个文件。
文件详解
- 输入文件
- 文件名称:Cinclosoma_IM_in.txt、Cinclosoma_noST_SB_in.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含物种分化分析的输入参数及序列数据信息,支持种群历史动态模型构建。
- XML分析文件
- 文件名称:clarum_noST_SB_EBSP.xml、castanotum_EBSP.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:基于扩展贝叶斯天际线模型的种群大小历史推断文件,记录铜背鹑鸫和栗胸鹑鸫的种群动态参数。
- CSV数据文件
- 文件名称:Cinclosoma Coordinates.csv、Cinclosoma _Codominant.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含鸟类采样点地理坐标数据(Cinclosoma Coordinates.csv)及共显性基因位点数据(Cinclosoma _Codominant.csv),支持地理分布与基因多样性关联分析。
数据来源
论文“Multi-locus sequence data illuminate demographic drivers of Pleistocene speciation in semi-arid southern Australian birds (Cinclosoma spp.)”
适用场景
- 物种形成机制研究: 分析更新世气候波动对澳大利亚非冰川区鸟类物种分化的驱动作用。
- 种群历史动态分析: 利用贝叶斯模型推断铜背鹑鸫和栗胸鹑鸫的种群大小变化历史。
- 生物地理学研究: 通过地理坐标数据探究鸟类分布与栖息地变化的关系。
- 基因流与遗传多样性分析: 基于共显性基因位点数据,研究物种间基因交流及遗传结构差异。