数据集概述
本数据集为Busseola fusca(鳞翅目夜蛾科)跨撒哈拉以南非洲的系统地理学研究数据,包含628个个体的7个微卫星基因座分型数据、130个采样点位置信息及相关分析脚本。通过结合物种分布模型(SDM)与电路理论,分析不同气候期连续迁移对种群遗传分化的影响,揭示达荷美 Gap东缘为主要分化因素。
文件详解
- README_for_R_scripts_and_Data.txt
- 文件格式:TXT
- 内容说明:包含R脚本运行说明,如R版本要求(3.02)、文件解压步骤、工作目录设置及脚本执行命令(install_libraries.R、Functions_SDM_Connectivity.R、Commands.R)。
- R_scripts_and_Data.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容说明:压缩包,包含用于物种分布模型(SDM)与电路理论分析的R脚本及相关数据文件。
- sample_locations.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射:包含采样个体的编号(如0007MaliBamako)、经度(X)、纬度(Y)等地理信息。
- genetic_data.txt
- 文件格式:TXT
- 内容说明:包含628个个体的7个微卫星基因座的基因型数据,用于种群遗传分化分析。
数据来源
论文“Phylogeography in continuous space: coupling species distribution models and circuit theory to assess the effect of contiguous migration at different climatic periods on genetic differentiation in Busseola fusca (Lepidoptera: Noctuidae)”
适用场景
- 种群遗传学研究:分析Busseola fusca的遗传分化模式、种群聚类及地理隔离因素(如达荷美 Gap)。
- 物种分布模型应用:结合SDM与电路理论,评估不同气候期(当前、末次间冰期、末次盛冰期)对种群连通性的影响。
- 气候变化对物种遗传的影响:通过未来气候(2080年)预测,分析遗传分化的潜在变化趋势。
- 生物信息学方法验证:验证电路-SDM方法在连续分布物种遗传分化预测中的有效性。