数据集概述
本数据集包含2013-2015年中国南方(广西)犬源甲型流感病毒(CIV)的基因数据,涉及新型重组病毒的进化研究。数据覆盖H1N1、H1N2、H3N2等重组基因型,来源于宠物犬、肉用犬及流浪犬群体,反映病毒跨宿主传播及重组特性,为动物疫病监测与公共卫生风险评估提供支持。
文件详解
- 基因片段文件(共8个)
- 文件名称:CIV.NS.xml、CIV.H1e.xml、CIV.PB2p.xml、CIV.NPp.xml、CIV.N1e.xml、CIV.MPe.xml、CIV.PAp.xml、CIV.PB1p.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:包含病毒各基因片段(NS、H1、PB2、NP、N1、MP、PA、PB1)的序列数据及相关元信息,记录病毒基因型、宿主来源、采样时间与地点等关键信息,支持重组事件及进化分析。
数据来源
论文“Emergence and evolution of novel reassortant influenza A viruses in canines in southern China”
适用场景
- 动物流感病毒进化研究: 分析犬源甲型流感病毒的重组机制、基因型多样性及跨宿主传播路径。
- 公共卫生风险评估: 评估犬源重组流感病毒的 zoonotic(人兽共患病)潜在风险,支持疫病预警。
- 兽医临床监测: 为宠物医院及动物疫病防控机构提供犬流感病毒基因数据参考,指导诊断与防控。
- 病毒生态学研究: 探索不同犬群(宠物、肉用、流浪犬)中流感病毒的传播生态与流行规律。