数据集概述
本数据集是论文“Integrating phylogenetic and ecological distances reveals new insights into parasite host specificity”的补充数据,包含鸟类特征数据、原始感染数据及分析代码。通过整合宿主系统发育与功能距离,分析疟原虫(Plasmodium和Haemoproteus spp.)对美拉尼西亚鸟类的宿主特异性,探究宿主亲缘关系与生态属性对寄生虫感染的影响,共包含3个文件。
文件详解
- Clark_Clegg_Supplementary_Data_BirdTraits.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含物种(Species)、宿主(Host)、GT、OUV等分类及功能特征字段,以及喙长(Bill_length)、翼长(Wing_length)等形态学指标,Diet.Inv等食性相关字段。
- Clark_Clegg_Supplementary_Data_RawInfectionData.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含鸟类个体(bird)、宿主(Host)、区域(Region)、感染状态(infected)、寄生虫谱系(Lineage)、疟原虫(Plas)、血变形虫(Haem)等感染数据,以及宿主分类阶元(IOCOrder、BLFamilyLatin)等信息。
- Clark_Clegg_Supplementary_Data_RCode.docx
- 文件格式:DOCX
- 内容介绍:用于分析本研究数据的R语言代码文档。
数据来源
论文“Integrating phylogenetic and ecological distances reveals new insights into parasite host specificity”
适用场景
- 寄生虫宿主特异性机制研究:分析宿主系统发育与生态特征对疟原虫感染范围的影响。
- 鸟类-寄生虫群落组装分析:探究宿主群落系统发育β多样性与寄生虫β多样性的关联。
- 生物信息学方法验证:利用整合多距离的分析方法,验证系统发育与功能距离在病原体宿主特异性研究中的应用价值。
- 生态流行病学研究:识别“栖息地 specialist”等特殊寄生虫的宿主选择模式,为疾病风险评估提供依据。