数据集概述
本数据集为新西兰普通竹节虫Clitarchus hookeri的从头转录组分析结果,包含嗅觉、消化及有性生殖相关基因信息。通过对不同组织转录组的分析,识别出嗅觉相关基因家族、消化酶基因(如纤维素酶、果胶酶)及雄性生殖相关候选蛋白,为研究竹节虫功能生物学提供分子基础,共含3个文件。
文件详解
- 文件名称:README_for_Choo_5tissues_transcriptome.fasta.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:竹节虫5组织转录组数据的说明文档,可能包含数据背景、样本信息、分析方法及文件使用指南等内容
- 文件名称:Choo_5tissues_transcriptome.fasta.gz
- 文件格式:GZ(压缩包)
- 字段映射介绍:压缩的转录组序列文件,包含竹节虫5种组织的转录组拼接结果,为FASTA格式的核苷酸序列数据
- 文件名称:Choo_scaffolds.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:竹节虫转录组拼接得到的 scaffolds 序列文件,为核苷酸序列数据,用于基因注释及功能分析
数据来源
论文“De novo transcriptome analysis of the common New Zealand stick insect Clitarchus hookeri (Phasmatodea) reveals genes involved in olfaction, digestion and sexual reproduction”
适用场景
- 竹节虫分子功能研究:分析嗅觉、消化及生殖相关基因的功能与表达模式
- 昆虫基因家族进化分析:探究嗅觉基因、纤维素酶基因等家族的进化历程与基因重复事件
- 水平基因转移研究:验证果胶酶基因的水平转移来源及功能
- 昆虫生殖调控机制研究:解析雄性附腺蛋白对雌性生殖的调控作用
- 转录组数据分析方法参考:为其他昆虫的从头转录组分析提供流程与资源借鉴