数据集概述
本数据集聚焦艰难梭菌(Clostridioides difficile)在肠道微生物互作下的抗生素响应,通过自下而上构建肠道群落模型,探究菌群互作对其抗生素敏感性的影响,包括高浓度抗生素下的耐受性提升和低浓度下的生长增强两类现象,结合转录组数据揭示脱硫弧菌产硫化氢导致甲硝唑耐受性的机制,共包含16个数据文件。
文件详解
- 数据文件(共16个)
- 丰度数据文件:以“Abundance_data”开头,对应不同图表(如Fig6A、SuppFig9A等),格式为.csv或.xlsx,包含时间(Time)、重复样本(Rep)、菌OD值(如D. piger OD raw)、抗生素浓度等字段,记录菌群生长丰度变化
- 硫化氢数据文件:以“H2S”开头,对应图表(如Fig6A、SuppFig13A等),格式为.csv,记录硫化氢相关实验数据
- 文件格式分布:.csv格式11个(占68.75%),.xlsx格式5个(占31.25%)
适用场景
- 肠道微生物互作机制研究:分析肠道菌群间互作对艰难梭菌抗生素响应的影响
- 抗生素耐受性研究:探究脱硫弧菌产硫化氢提升艰难梭菌甲硝唑耐受性的分子机制
- 微生物生态学分析:研究低抗生素浓度下菌群竞争对艰难梭菌生长的增强效应
- 临床治疗干预研究:为艰难梭菌感染的靶向治疗提供微生物互作层面的理论依据