数据集概述
本数据集为溶剂产生梭菌的系统基因组学与遗传分析补充材料,包含David Jones教授工业菌株库中270株溶剂产生梭菌的基因组序列及分析数据,涉及6个物种的系统发育、核心生物合成基因、次级代谢产物等特征,共12个文件,支持溶剂产生菌的工程改造及微生物化学合成研究。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称:README.md
- 文件格式:MD
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含数据背景、研究支持的出版物信息及文件内容概述
- 数据文件(.xlsx格式,共11个)
- 文件名称:Supplementary_Table_1_DJ_genome_accession_number_and_summary_stats.xlsx
- 字段映射介绍:DJ菌株库基因组登录号及汇总统计信息
- 文件名称:Supplementary_Table_3_NCP_Culture_Collection_Details.xlsx
- 字段映射介绍:NCP培养物保藏详情
- 文件名称:Supplementary_Table_4_ABE_protein_sequences.xlsx
- 字段映射介绍:ABE蛋白序列数据
- 文件名称:Supplementary_Table_6_cellulosome_elements.xlsx
- 字段映射介绍:纤维小体元件信息
- 文件名称:Supplementary_Table_7_GH_distribution.xlsx
- 字段映射介绍:GH(糖基水解酶)分布统计
- 文件名称:Supplementary_Table_8_plasmids.xlsx
- 字段映射介绍:质粒相关数据
- 文件名称:Supplementary_Table_9_prophages.xlsx
- 字段映射介绍:前噬菌体数据
- 文件名称:Supplementary_Table_11_CRISPR_matches.xlsx
- 字段映射介绍:CRISPR匹配信息
适用场景
- 微生物基因组学研究:分析溶剂产生梭菌的系统发育关系及核心基因特征
- 工业菌株工程改造:基于基因组数据优化梭菌的溶剂生产能力
- 生物合成路径分析:探究ABE(丙酮-丁醇-乙醇)等溶剂的生物合成基因及蛋白序列
- 次级代谢产物研究:挖掘梭菌的次级代谢产物相关基因资源
- 微生物化学合成应用:将基因序列应用于酵母或大肠杆菌等平台生物催化剂以增强化学合成能力