Clupea_pallasii_Based_东北大西洋太平洋鲱鱼系统地理学研究数据

数据集概述

本数据集围绕东北大西洋海域太平洋鲱鱼(Clupea pallasii)的系统地理学研究展开,基于线粒体DNA序列数据,分析其跨北极迁徙历史、种群遗传结构及多样性特征,包含8个相关数据文件,支持种群分化、殖民瓶颈效应及分子速率时间依赖性等研究方向。

文件详解

  • 线粒体DNA序列数据文件(TXT)
  • 文件名称:IM_CYTB_NWP_WSI.txt、IM_CYTB_NWP_MEZCHE.txt、IM_CYTB_NWP_BLS.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:包含太平洋鲱鱼细胞色素b(CYTB)基因序列信息,涉及种群标识(如WhiteSea_Indiga、Mezen/Chesha Bays、Balsfjord)、样本编号、基因片段长度、碱基组成及遗传多样性参数等内容。
  • 样本信息文件(XLS)
  • 文件名称:SampleID_list.xls
  • 文件格式:XLS
  • 字段映射介绍:记录太平洋鲱鱼研究样本的唯一标识列表,用于关联各数据文件中的样本数据。
  • 多维尺度分析距离矩阵文件(XLSX)
  • 文件名称:Distance matrix for the MDS ordination.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含用于多维尺度(MDS)排序分析的遗传距离矩阵数据,支持种群遗传结构的可视化研究。
  • 种群遗传分析输入文件(ARP)
  • 文件名称:Arlq_cr_populations.arp、Arlq_trans_Arctic_populations_concat.arp、Arlq_cytb_populations.arp
  • 文件格式:ARP
  • 字段映射介绍:Arlequin软件分析输入文件,分别对应控制区(cr)种群、跨北极合并种群及细胞色素b(cytb)种群的遗传数据,用于种群分化、基因流等分析。

数据来源

论文“Phylogeography of amphi-boreal fish: tracing the history of the Pacific herring Clupea pallasii in North-East European seas”

适用场景

  • 海洋鱼类系统地理学研究:分析太平洋鲱鱼跨北极迁徙历史及东北大西洋种群的殖民起源。
  • 种群遗传多样性评估:探究东北大西洋不同海域(白海、梅津湾、巴尔峡湾等)太平洋鲱鱼种群的遗传分化及瓶颈效应。
  • 分子进化速率分析:对比线粒体编码区与非编码区的突变动态,研究分子速率的时间依赖性。
  • 海洋生物地理连通性研究:结合软体动物类群(Macoma、Mytilus)的系统地理模式,揭示跨北极生物类群的连通历史共性。
  • 渔业资源管理:为东北大西洋太平洋鲱鱼种群的分类及保护策略制定提供遗传数据支持。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 2.29 MiB
最后更新 2026年1月15日
创建于 2026年1月15日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。