数据集概述
本数据集围绕“Candidatus Mycoplasma haemominutum”(CMhm)这一猫红细胞细菌病原体,研究其在共存的家猫与野生猫科动物间的跨物种传播机制与溢出风险。通过分析病原体流行率、建模传播路径、基因分型及系统发育分析,探究直接(种间捕食)与间接(媒介传播)路径的作用,揭示家猫作为全球扩散源向野生猫科动物溢出的可能性。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称:README_for_Phylogenetics.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:提供系统发育分析相关的说明文档,内容可能涵盖基因分型方法、16S rRNA基因序列分析流程、系统发育树构建及祖先状态重建的技术细节
- 文件名称:README_for_Transmission_models.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:提供传播模型相关的说明文档,内容可能涵盖CMhm流行率数据分析方法、传播路径建模参数、模型选择标准及结果解释逻辑
- 压缩类文件
- 文件名称:Transmission_models.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含传播模型分析的原始数据或处理后数据,可能涉及CMhm流行率统计数据、传播路径模拟参数、模型输出结果等
- 文件名称:Phylogenetics.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含系统发育分析的相关数据,可能涉及CMhm病原体16S rRNA基因序列数据、基因型分型结果、系统发育树构建的输入输出文件及祖先状态重建数据
数据来源
论文“Transmission pathways and spillover of an erythrocytic bacterial pathogen from domestic cats to wild felids”
适用场景
- 猫科动物病原体跨物种传播机制研究: 分析CMhm在不同猫科动物间的传播路径(直接/间接)及溢出事件频率
- 野生动物疾病风险评估: 评估家猫作为病原体源向野生猫科动物溢出的风险,为野生动物保护提供数据支持
- 病原体系统发育分析: 利用16S rRNA基因序列数据,研究CMhm病原体的基因型多样性及进化关系
- 疾病传播模型构建: 基于流行率数据和传播路径模拟,优化跨物种病原体传播的预测模型
- 捕食行为与疾病传播关联研究: 探究种间捕食行为在病原体跨物种传播中的作用机制