数据集概述
本数据集为研究神经性厌食症(AN)内源性大麻素系统功能障碍的论文配套数据,包含从AN患者及匹配健康对照者唾液样本中生成的分子数据与分析代码,聚焦CNR1和FAAH基因的表观遗传调控,共5个文件。
文件详解
- Dataset S1 - 人口统计学与临床数据
- 文件名称:DatasetS1_demographic_clinical_data_participants.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含研究参与者的人口统计学与临床信息,“Group”列标注对照(CTRL)或AN患者(AN),另有BMI(单位:kg/m²)、AN诊断年龄(“Age of onset”)等字段。
- Dataset S2 - DNA甲基化数据
- 文件名称:DatasetS2_DNAmethylation.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录CNR1和FAAH基因启动子区域单个CpG位点的甲基化百分比(0-100%),含按对照组与AN组分层的每个基因所有CpG位点平均甲基化水平(AVE)。
- Dataset S3 - SNP基因分型数据
- 文件名称:DatasetS3_SNP_analysis.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:列出CTRL与AN样本中CNR1基因rs1049353位点、FAAH基因rs324420位点的等位基因分型结果。
- Dataset S4 - miRNA表达数据
- 文件名称:DatasetS4_miRNA_expression.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:提供靶向CNR1(miR-16-2-5p等4种)与FAAH(miR-4505等4种)的miRNA在CTRL与AN样本中的log2倍变化值(log2FC),缺失值为因质控(参考miRNA扩增延迟)排除的测量数据。
- RCode - 转录因子结合位点分析代码
- 文件名称:Rcode_TF.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:用于识别受CNR1和FAAH基因差异甲基化CpG位点影响的转录因子(TF)的R脚本,通过JASPAR2024数据库(JASPAR2024 R包)进行基序扫描,含多步过滤策略(选择CpG敏感基序、相关CpG位置保守性评分≥0.8的TF)。
数据来源
论文“Coordinated epigenetic dysregulation of CNR1 and FAAH genes drives endocannabinoid system dysfunction in Anorexia Nervosa”
适用场景
- 神经性厌食症表观遗传机制研究:分析CNR1和FAAH基因甲基化、SNP及miRNA表达变化与AN发病的关联。
- 内源性大麻素系统功能障碍研究:探究表观遗传失调对AN患者内源性大麻素系统功能的影响。
- 转录因子调控分析:利用R代码研究差异甲基化CpG位点对转录因子结合的影响。
- 生物标志物开发:评估CNR1和FAAH基因的表观遗传指标作为AN诊断或预后生物标志物的潜力。
- 精准医疗研究:为AN的靶向治疗(针对表观遗传调控通路)提供分子数据支持。