数据集概述
本数据集包含CODEX多通道成像技术生成的细胞数据,用于通过STELLAR方法实现细胞类型注释向其他组织和供体的迁移。数据涵盖3名供体的24个人肠组织切片、人扁桃体及巴雷特食管组织的成像结果,经标准化处理后形成含87万和22万细胞的荧光值数据框,支持细胞类型注释迁移研究。
文件详解
- 数据文件(CSV格式,共3个)
B0056_unnanotated_dryad.csv:包含MUC2、SOX9、MUC1、CD31等47种抗体标记的荧光值数据
B004_training_dryad.csv:包含与上述相同的抗体标记荧光值数据,用于训练场景
BE_Tonsil_l3_dryad.csv:包含人扁桃体及巴雷特食管组织的抗体标记荧光值数据
- 文档文件(DOCX格式,共1个)
README_CODEXdata_STELLAR.docx:数据集说明文档,提供数据背景、处理流程及使用指引
适用场景
- 细胞类型注释迁移研究:利用STELLAR方法实现细胞类型注释在不同组织和供体间的迁移
- 生物医学成像数据分析:分析CODEX多通道成像技术生成的细胞荧光值数据
- 组织特异性细胞标记研究:探索不同组织(肠、扁桃体、巴雷特食管)中细胞标记物的表达模式
- 机器学习模型训练:基于标注数据训练细胞类型识别与注释迁移模型