数据集概述
本数据集为甲虫Y染色体演化研究的支撑数据,包含4724种甲虫的核型数据库、1126个类群的系统发育树及基因序列信息,用于分析Y染色体得失速率及“脆弱Y”假说(减数分裂交叉依赖导致Y染色体丢失)。
文件详解
- README_for_seq.data.txt:TXT格式,序列数据说明文档
- README_for_coleoptera.trees.txt:TXT格式,甲虫系统发育树说明文档
- seq.data.csv:CSV格式,含所有类群及GenBank登录号的序列数据表,标注嵌合OTU(+表示高于物种的分类单元,锚点功能嵌合OTU)
- coleoptera.trees.zip:ZIP格式,甲虫系统发育树压缩文件
数据来源
论文“Estimating tempo and mode of Y chromosome turnover: explaining Y chromosome loss with the fragile Y hypothesis”
适用场景
- 昆虫遗传学研究:分析甲虫性别决定系统多样性及Y染色体演化模式
- 进化生物学分析:估算Y染色体得失速率及系统发育分布特征
- 减数分裂机制研究:验证“脆弱Y”假说中交叉依赖与Y染色体丢失的关联
- 生物信息学应用:利用系统发育树与基因序列数据开展比较基因组学分析