数据集概述
本数据集为Colman等人2022年发表的黄石热泉地下古菌研究的补充数据,记录了与快速地球生物学变化相关的地下古菌信息,包含基因组装、蛋白质数据及配套表格,共12份文件,覆盖.xlsx、.fasta、.faa三种格式,支撑地热环境微生物生态研究。
文件详解
- 基因组装文件(.fasta格式)
- 文件名称:CP2016.0m.assembly.fasta、CP2020.0m.assembly.fasta、CP2016.15m.assembly.fasta、CP2016.9m.assembly.fasta、CP2020.15m.assembly.fasta等共6个文件
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:存储不同年份(2016、2020)、不同深度(0m、9m、15m)采样点的基因组装序列数据
- 补充表格文件(.xlsx格式)
- 文件名称:Colman et al. 2022 - Supplementary Dataset S1.xlsx至S5.xlsx共5个文件
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:研究相关的结构化补充数据表格,具体字段未披露(无预览)
- 蛋白质数据文件(.faa格式)
- 文件名称:Colman et al. 2022 - Unbinned Protein Data.faa
- 文件格式:FAA
- 字段映射介绍:未分箱的蛋白质序列数据,与古菌研究相关
数据来源
论文“Subsurface Archaea Associated with Rapid Geobiological Change in a Model Yellowstone Hot Spring”(Communications Earth & Environment)
适用场景
- 地热环境微生物生态学研究: 分析黄石热泉地下古菌的群落结构与分布特征
- 地球生物学变化机制探索: 关联古菌数据与地热环境的快速地球生物学变化过程
- 微生物基因与蛋白质分析: 基于.fasta和.faa文件开展古菌基因组装、蛋白质序列研究
- 地热生态系统演化分析: 结合不同年份、深度的采样数据,探究热泉生态系统的时间与空间变化规律