数据集概述
本数据集包含CoMET模型(CPP on Mass-Extinction Times)相关的脚本与模拟数据,用于检测大灭绝事件对分子系统发育的影响。该模型通过贝叶斯方法,在谱系多样化速率变化的情况下,区分背景多样化速率变异与大灭绝事件,提供大灭绝事件数量、时间的无偏估计,可支持生物进化研究。
文件详解
- README文件
- 文件名称:README_for_dryad_package.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据存档说明,说明脚本用途(生成和分析手稿数据)、模拟数据内容,以及五个子目录(对应手稿中的模拟/分析集)的描述,同时提示分析的计算成本与耗时。
- 压缩包文件
- 文件名称:dryad_package.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含脚本与模拟数据的压缩存档,内部分为五个子目录,对应手稿中的不同模拟和分析内容。
数据来源
论文“A Bayesian approach for detecting the impact of mass-extinction events on molecular phylogenies when rates of lineage diversification may vary”
适用场景
- 分子系统发育分析: 检测大灭绝事件对生物类群分子系统发育的影响,估计事件数量与时间。
- 生物进化研究: 分析谱系多样化速率变化背景下,大灭绝事件的作用机制。
- 模型验证与应用: 验证CoMET模型的有效性,应用于实际生物类群(如针叶树)的大灭绝事件研究。
- 计算生物学方法探索: 研究贝叶斯方法在处理复杂系统发育数据中的应用。