数据集概述
本数据集基于全转录组单核苷酸多态性数据，对比分析21份向日葵自然种群与19份驯化种群的有害突变负荷，同时扩展研究菊科其他驯化物种（ globe artichoke、cardoon）的同类模式，揭示驯化改良过程中有害突变积累规律及低重组区域的选择效率差异，共包含6个相关文件。
文件详解
- 文件名称：snp_table_all3（无扩展名）
- 文件格式：无扩展名
- 字段映射介绍：全转录组单核苷酸多态性（SNP）综合数据表，包含自然种群与驯化种群的SNP位点信息
- 文件名称：new_provean_results_all（无扩展名）
- 文件格式：无扩展名
- 字段映射介绍：Provean工具预测的有害突变结果数据，评估突变对蛋白质功能的影响
- 文件名称：new_sift_results_all（无扩展名）
- 文件格式：无扩展名
- 字段映射介绍：SIFT工具预测的有害突变结果数据，分析突变的功能危害性
- 文件名称：new_snp_table_effect（无扩展名）
- 文件格式：无扩展名
- 字段映射介绍：SNP位点功能效应数据表，关联突变位点与基因功能影响
- 文件名称：table_S1_24_02_15.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：补充表格数据，包含研究相关的详细统计或原始数据记录
- 文件名称：unique_orf（无扩展名）
- 文件格式：无扩展名
- 字段映射介绍：唯一开放阅读框（ORF）数据，记录基因编码区域的参考序列信息
数据来源
论文“The accumulation of deleterious mutations as a consequence of domestication and improvement in sunflowers and other Compositae crops”
适用场景
- 作物驯化遗传机制研究：分析向日葵及菊科作物驯化过程中有害突变积累的分子机制
- 有害突变预测模型验证：对比Provean与SIFT工具对作物有害突变的预测效果及一致性
- 作物育种遗传负荷评估：评估驯化作物的有害突变负荷，为作物改良提供遗传依据
- 基因组重组与选择效率分析：研究低重组区域对有害突变净化选择效率的影响规律
- 菊科作物比较遗传学研究：对比不同菊科驯化物种的有害突变积累模式及进化差异
