数据集概述
本数据集包含与20S核心颗粒及其PA28调节因子的HDX-MS分析相关的数据和R脚本。通过氢氘交换质谱技术(HDX-MS)研究人源标准20S(std20S)和免疫20S(i20S)蛋白酶体单独或与PA28αβ、PA28γ激活剂复合物的构象差异,分析其溶剂可及性(氘代动力学形式),揭示PA28依赖和免疫依赖的环间串扰。
文件详解
- 文件名称:HDX-MS-proteasome_v101.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容说明:压缩包内包含与20S核心颗粒及其PA28调节因子的HDX-MS分析相关的数据文件和R脚本,用于分析人源标准20S和免疫20S蛋白酶体单独或与PA28激活剂复合物的构象差异,包括氘代动力学数据、统计分析结果及3D可视化相关脚本。
适用场景
- 蛋白质构象研究:分析人源20S蛋白酶体不同亚型(std20S、i20S)及其与PA28激活剂复合物的构象差异。
- 酶学机制分析:探究PA28激活剂结合对20S蛋白酶体β环构象变化及溶剂可及性的影响。
- 结构生物学研究:验证HDX-MS技术在溶液中大型多蛋白复合物结构解析中的应用价值。
- 免疫相关蛋白质功能研究:揭示免疫20S蛋白酶体与PA28激活剂相互作用的特异性变构效应。