从全原子模拟数据创建粗粒化相互作用势数据集

数据集概述

本数据集基于经典分子动力学模拟的径向分布函数(RDF),围绕乙醇(ETH)和三氟乙醇(TFE)物种构建粗粒化相互作用势,并与全原子势对比,用于验证其对介观尺度系统物理特性的捕获能力。

文件详解

  • 迭代数据文件:
  • 4th-Iteration-Data.xlsx、2nd Iteration Data.xlsx、3rd-Iteration-Data.xlsx、Potential-Iteration-2.xlsx等(.xlsx格式):记录各迭代过程中的模拟数据与势函数迭代结果
  • 分子结构文件:
  • cf3ch2oh.pdb、ethanol.pdb(.pdb格式):三氟乙醇、乙醇的分子结构文件
  • 径向分布函数(RDF)数据文件:
  • rdf_t100_e100_etoh_tfe.dat、rdf_t150_e50_etoh_etoh.dat、rdf_t200_tfe_tfe.dat等(.dat格式):不同温度、浓度下乙醇-乙醇、乙醇-三氟乙醇、三氟乙醇-三氟乙醇的径向分布函数数据
  • 迭代数据文件:
  • 3_ETH_ETH.dat、3_ETH_TFE_50_50.dat等(.dat格式):乙醇-乙醇、乙醇-三氟乙醇(50:50浓度)的迭代模拟数据
  • 配置文件:
  • s1_100.config、s1_50_s2_50.config等(.config格式):不同浓度比例的系统配置文件
  • 图片文件:
  • tfemax.jpeg、ethanolmax.jpeg、tfe.jpeg、ethanol.jpeg(.jpeg格式):乙醇、三氟乙醇相关的可视化图片
  • 文档与压缩文件:
  • Creating a Coarse-Grain Interaction Potential from All-Atom Simulation Data.pdf(.pdf格式):数据集说明文档;Data.zip(.zip格式):压缩数据文件

适用场景

  • 分子动力学模拟研究:验证粗粒化势函数对乙醇、三氟乙醇体系物理特性的模拟能力
  • 介观尺度系统分析:探索粗粒化模型在介观尺度系统中的应用潜力
  • 势函数迭代优化:基于径向分布函数数据优化粗粒化相互作用势
  • 化学物理研究:分析乙醇与三氟乙醇体系的相互作用规律
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 2.86 MiB
最后更新 2025年11月27日
创建于 2025年11月27日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。