数据集概述
本数据集基于经典分子动力学模拟的径向分布函数(RDF),围绕乙醇(ETH)和三氟乙醇(TFE)物种构建粗粒化相互作用势,并与全原子势对比,用于验证其对介观尺度系统物理特性的捕获能力。
文件详解
- 迭代数据文件:
- 4th-Iteration-Data.xlsx、2nd Iteration Data.xlsx、3rd-Iteration-Data.xlsx、Potential-Iteration-2.xlsx等(.xlsx格式):记录各迭代过程中的模拟数据与势函数迭代结果
- 分子结构文件:
- cf3ch2oh.pdb、ethanol.pdb(.pdb格式):三氟乙醇、乙醇的分子结构文件
- 径向分布函数(RDF)数据文件:
- rdf_t100_e100_etoh_tfe.dat、rdf_t150_e50_etoh_etoh.dat、rdf_t200_tfe_tfe.dat等(.dat格式):不同温度、浓度下乙醇-乙醇、乙醇-三氟乙醇、三氟乙醇-三氟乙醇的径向分布函数数据
- 迭代数据文件:
- 3_ETH_ETH.dat、3_ETH_TFE_50_50.dat等(.dat格式):乙醇-乙醇、乙醇-三氟乙醇(50:50浓度)的迭代模拟数据
- 配置文件:
- s1_100.config、s1_50_s2_50.config等(.config格式):不同浓度比例的系统配置文件
- 图片文件:
- tfemax.jpeg、ethanolmax.jpeg、tfe.jpeg、ethanol.jpeg(.jpeg格式):乙醇、三氟乙醇相关的可视化图片
- 文档与压缩文件:
- Creating a Coarse-Grain Interaction Potential from All-Atom Simulation Data.pdf(.pdf格式):数据集说明文档;Data.zip(.zip格式):压缩数据文件
适用场景
- 分子动力学模拟研究:验证粗粒化势函数对乙醇、三氟乙醇体系物理特性的模拟能力
- 介观尺度系统分析:探索粗粒化模型在介观尺度系统中的应用潜力
- 势函数迭代优化:基于径向分布函数数据优化粗粒化相互作用势
- 化学物理研究:分析乙醇与三氟乙醇体系的相互作用规律