数据集概述
本数据集为受威胁物种刷尾兔鼠（Conilurus penicillatus）的种群基因组研究数据，包含其基因组多样性、种群结构及保护管理分析相关的样本元数据、基因型数据、分析脚本等，旨在为该物种的保护规划提供遗传多样性空间分布信息，支持种群保护优先级评估与 translocation 策略制定。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称：README_Conilurus.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：数据集说明文档，包含数据背景、文件清单及使用指引等基础信息
- 样本元数据文件
- 文件名称：samp_info_070820.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含样本编号（sample）、种群（popn）、纬度（lat）、经度（long）等样本地理与种群归属信息
- 文件名称：CP_sample_metadata071219.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：刷尾兔鼠样本的详细元数据，内容涵盖样本采集及实验相关的补充信息
- 基因型数据文件
- 文件名称：filtered_genotypes.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内为经过过滤处理的基因型数据
- 文件名称：all_loci_coni_290720.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含染色体（chromo）、位点（site）、基因座（locus）等全基因座信息
- 分析脚本文件
- 文件名称：scripts.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内为用于数据分析的脚本文件
- 分析输出文件
- 文件名称：angsd_output.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：ANGSD软件生成的基因组分析输出结果压缩包
- 空间数据文件
- 文件名称：rasters_hypervolume.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含栅格（raster）数据的压缩包，用于物种生态位等空间分析
数据来源
论文“Population genomics and conservation management of a declining tropical rodent”
适用场景
- 种群基因组学研究: 分析刷尾兔鼠种群结构、基因组多样性及分化模式（如Tiwi群岛与大陆种群的遗传差异）
- 保护优先级评估: 基于等位基因保留率等指标，确定物种保护的关键种群
- 保护策略制定: 为刷尾兔鼠的 translocation 策略提供基因组与生态分化依据，指导种群保护规划
- 生态位分析: 利用栅格数据研究物种生态位特征，评估种群的环境适应性与保护潜力
- 生物多样性保护研究: 为热带啮齿动物濒危机制及保护管理提供基因组层面的案例参考
