数据集概述
本数据集聚焦回声定位鸟类与哺乳动物的听力基因趋同研究,包含37个文件,涉及基因序列、候选基因列表、回声定位参数分类等内容,用于分析不同回声定位动物类群中听力相关基因的选择模式与趋同进化特征,为理解回声定位感官机制提供数据支持。
文件详解
- 基因序列文件(.fas格式,共32个)
- 示例文件:DZIP1_mammalbird_trim.fas、PJVK_mammalbird_trim.fas、TJP2_bird.fas等
- 内容说明:包含不同物种(哺乳动物、鸟类)的听力相关基因修剪后序列,用于基因进化分析
- 数据表格文件(.xlsx格式,共2个)
- accession_numbers_genes.xlsx:记录基因的登录号信息
- CSUBST_sites.xlsx:包含趋同替换位点数据
- 文档文件(.docx格式,1个)
- Candidate_genes_reported_to_be_positively_selected_or_evolving_convergently_in_classic_echolocators.docx:经典回声定位动物中受正选择或趋同进化的候选基因列表
- CSV文件(1个)
- Classification_of_parameters_of_echolocation_calls_across_mammals_and_birds.csv:记录哺乳动物与鸟类回声定位叫声参数分类,包含群体、叫声产生方式、类型、形式、峰值频率等字段
- 说明文件(.md格式,1个)
- README.md:数据集归属、贡献者及使用说明
数据来源
论文“Convergence in hearing genes between echolocating birds and mammals”
适用场景
- 基因进化研究:分析回声定位动物听力相关基因的趋同进化模式与选择压力
- 感官机制分析:探究鸟类与哺乳动物回声定位感官系统的分子适应机制
- 生物信息学分析:利用基因序列文件开展序列比对、系统发育树构建等分析
- 回声定位特征研究:结合叫声参数分类数据,关联基因变异与回声定位表型的关系
- 跨物种比较研究:对比不同回声定位动物类群(鸟类、哺乳动物)的基因适应差异