数据集概述
本数据集围绕新热带区鲶鱼亚科(Corydoradinae)的基因组大小变异展开研究,涉及65个物种的基因组大小量化、系统发育树构建、全基因组复制(WGD)事件鉴定及转座子(TE)丰度分析,揭示基因组扩张的进化机制。
文件详解
- 文件名称:cory_final_bmodel.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:包含用于分析Corydoradinae鲶鱼基因组进化的统计模型数据,涉及基因组大小变异、全基因组复制事件时间校准、转座子丰度变化等相关模型参数与结构信息。
数据来源
论文“Whole genome duplication and transposable element proliferation drive genome expansion in Corydoradinae catfishes”
适用场景
- 基因组进化机制研究: 分析全基因组复制和转座子增殖对Corydoradinae鲶鱼基因组扩张的驱动作用。
- 物种系统发育分析: 基于化石校准的系统发育树,探究基因组大小变异的进化历史与时间节点。
- 转座子生物学研究: 量化不同谱系中转座子的丰度变化,揭示其对基因组大小的影响。
- 进化遗传学研究: 研究全基因组复制事件对物种遗传变异和基因表达的影响,评估其对谱系进化潜力的作用。