数据集概述
本数据集聚焦全球酵母遗传互作网络的环境稳健性研究,系统分析了14种不同环境条件下30,000对功能代表性酵母基因对的动态差异互作,揭示环境对遗传网络可塑性的影响,为理解真核细胞基本功能架构提供数据支持。
文件详解
- 说明文档
- 文件名称:Data_File_descriptions_Readme_20210220.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:数据集文件描述说明文档
- 原始互作数据集
- 文件名称:Costanzo_et_al_Data_File_3_Raw_interaction_dataset.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:原始基因互作数据记录
- 条件、菌株与适应性数据
- 文件名称:Costanzo_et_al_Data_File_1_Conditions_Strains_Fitness.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:14种实验条件、酵母菌株及适应性相关数据
- SMF功能富集分析数据
- 文件名称:Costanzo_et_al_Data_File_2_SMF_Functional_enrichment.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:基于SMF方法的功能富集分析结果
- MCMC共识谱数据
- 文件名称:Costanzo_et_al_Data_File_4_MCMC_consensus_profiles.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)方法生成的共识谱数据
- 功能一致性分析数据
- 文件名称:Costanzo_et_al_Data_File_5_Functional_coherence_analysis.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:基因功能一致性分析结果数据
数据来源
论文“Environmental robustness of the global yeast genetic interaction network”
适用场景
- 酵母遗传互作网络研究: 分析不同环境条件下酵母基因对的动态互作模式
- 环境对遗传网络影响研究: 探究环境因素对遗传互作网络可塑性的影响机制
- 基因功能关联分析: 基于差异互作数据挖掘远缘基因对间的新功能联系
- 真核细胞功能架构研究: 研究遗传互作网络的环境稳健性及其反映的细胞基本功能架构
- 计算生物学分析: 利用MCMC共识谱、功能富集等数据开展相关计算分析