数据集概述
本数据集围绕海洋腹足类海蛞蝓Costasiella ocellifera展开,包含其佛罗里达及加勒比海种群的遗传多样性、繁殖隔离相关数据。通过分析不同幼虫形态(浮游型与非浮游型)种群的线粒体及核基因位点,探究扩散能力丧失对种群连通性、遗传多样性及繁殖隔离的影响,支持海洋生物种群遗传学研究。
文件详解
- 线粒体基因数据文件
- 文件名称:Coce_COI_Evolution2015.nex、C_ocellifera master COI data.xls
- 文件格式:NEX、XLS
- 字段映射介绍:包含海蛞蝓COI基因序列数据及相关样本信息,支持种群遗传多样性分析
- 种群遗传分析输入文件
- 文件名称:Coce_msats_14pops.arp、Coce_13_pops.arp、Coce_msats.str
- 文件格式:ARP、STR
- 字段映射介绍:微卫星位点种群数据,用于种群遗传结构、连通性分析
- 系统发育分析文件
- 文件名称:Coce_COI_CaribP_run1.xml、Coce_GEI_COI_run1_v2.xml、Coce_Plana_COI_run1_v2.xml、Coce_LAK_COI_run1.xml、Coce_LSS_COI_run1_v2.xml、4runs_Coce_COI_post_burnin.nex.trees
- 文件格式:XML、TREES
- 字段映射介绍:系统发育分析参数设置文件及结果树文件,用于种群进化关系研究
- 其他文件
- 文件名称:02、03、05、06、07、08、09、10、11(编号文件)
- 文件格式:未明确(基于上下文推测为辅助分析文件)
- 字段映射介绍:辅助支持种群遗传多样性、繁殖隔离相关分析的补充数据
数据来源
论文“Reduced genetic diversity and increased reproductive isolation follow population-level loss of larval dispersal in a marine gastropod”
适用场景
- 海洋生物种群遗传学研究: 分析海蛞蝓不同种群的遗传多样性、连通性及进化关系
- 繁殖隔离机制探究: 研究扩散能力丧失对海洋生物繁殖隔离(包括合子后隔离、交配前隔离)的影响
- 幼虫扩散与种群结构关联分析: 验证浮游型与非浮游型幼虫形态对种群遗传结构的作用机制
- 海洋生物保护策略制定: 为海洋腹足类等海洋生物的保护提供种群遗传学数据支持
- 进化生物学理论验证: 验证扩散能力与遗传多样性、繁殖隔离关系的进化生物学理论