数据集概述
本数据集为韩国队列结直肠癌（CRC）的RNA-seq综合分析结果，包含214名参与者的381份样本（169份正常组织、212份肿瘤组织）的基因表达数据。识别出19,575个表达基因及3,830个差异表达基因，涉及细胞周期、代谢通路等功能注释，还结合临床信息与CMS亚型分析，为CRC分子机制研究提供参考，共含11个文件。
文件详解
- 表达量数据文件（TXT格式）
- 文件名称：遵循
CMCBSN_log2cpm_*.txt（如CMCBSN_log2cpm_342.txt）、CMCBSN_expectedcount_*.txt（如CMCBSN_expectedcount_381.txt）模式
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含样本ID（如PM-PM-1070-N-A1）作为列名，记录基因的log2cpm标准化表达量或预期计数
- 补充表格文件（XLSX格式）
- 文件名称：
Supplementary table1.xlsx至Supplementary table5.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含研究相关的补充信息，推测涵盖差异表达基因注释、功能富集结果、临床信息关联、CMS亚型分析等内容
适用场景
- 结直肠癌分子机制研究: 分析肿瘤与正常组织的差异表达基因，探究CRC发生发展的关键通路（如细胞周期、IL-17通路）
- 临床亚型关联分析: 结合CMS亚型与临床信息，研究CRC分子亚型的临床特征及预后价值
- 治疗靶点挖掘: 基于差异表达基因的功能注释，筛选CRC潜在治疗靶点
- 转录组数据分析方法验证: 利用标准化表达量数据验证基因表达分析算法的有效性
- 队列特异性分子特征研究: 探索韩国CRC患者特有的基因表达模式与分子特征
