数据集概述
本数据集为活板门蜘蛛科(Ctenizidae)系统发育研究的原始数据,包含通过锚定杂交富集(AHE)技术获取的基因组位点数据及系统发育分析文件。数据用于重建9个属的系统发育关系、验证科的单系性,并支持Halonoproctidae科的分类修订。数据集共包含2个文件,涉及基因组位点和系统发育分析相关内容。
文件详解
- ctenizid_loci_raw_fasta.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含通过锚定杂交富集技术获取的565个基因组位点的原始FASTA序列,涉及27个样本的115,209碱基对数据,用于系统发育关系重建。
- ctenizidae.phy
- 文件格式:PHY
- 字段映射介绍:系统发育分析格式文件,包含用于重建Ctenizidae科及相关类群系统发育树的序列矩阵数据,支持科单系性验证和分类单元亲缘关系分析。
数据来源
论文“Phylogeny of a cosmopolitan family of morphologically conserved trapdoor spiders (Mygalomorphae, Ctenizidae) using Anchored Hybrid Enrichment, with a description of the family, Halonoproctidae Pocock 1901”
适用场景
- 蜘蛛系统发育研究:用于分析Ctenizidae科9个属的亲缘关系,验证科的单系性。
- 生物分类学修订:支持Halonoproctidae科的分类学建立及Ctenizidae科亚科有效性的评估。
- 基因组位点分析:利用锚定杂交富集技术获取的位点数据,研究蜘蛛基因组进化特征。
- 生物地理学研究:结合系统发育结果,推断Halonoproctidae科共同祖先的地理分布。