数据集概述
本数据集为媒介昆虫Culicoides imicola地中海定殖研究的遗传数据,包含微卫星数据、多个基因(Efa、Cytb、COI)的序列比对文件及样本ID信息,共5个文件,用于分析该物种的种群遗传结构、定殖历史及与蓝舌病疫情的关联。
文件详解
- Jacquet_C.imicola_microsatellite_data.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含Culicoides imicola样本的微卫星基因型数据,记录样本ID及对应基因座的等位基因信息
- Jacquet_C.imicola_Efa_alignement.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:Efa基因的序列比对数据,用于种群遗传学分析
- Jacquet_C.imicola_Cytb_alignement.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:细胞色素b(Cytb)基因的序列比对数据,用于系统发育及种群历史分析
- Jacquet_C.imicola_COI_alignment.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:细胞色素氧化酶I(COI)基因的序列比对数据,用于物种鉴定及遗传分化分析
- Jacquet_C.imicola_SamplesID.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含样本ID及对应的来源信息,用于关联各遗传数据文件的样本背景
数据来源
论文“Colonization of the Mediterranean Basin by the vector biting midge species Culicoides imicola: an old story”
适用场景
- 媒介昆虫种群遗传结构分析: 利用微卫星数据及基因序列比对,研究Culicoides imicola在非洲及地中海区域的种群分化特征
- 物种定殖历史重建: 通过遗传数据推断Culicoides imicola地中海定殖的时间、路线及种群动态
- 媒介生物与疫病关联研究: 分析该物种遗传结构与蓝舌病疫情的关系,为疫病防控提供依据
- 昆虫分子生态学研究: 结合线粒体与核基因数据,探究气候变化对媒介昆虫分布及遗传多样性的影响