数据集概述
本数据集是CusVarDB工具研究的扩展数据,包含BT474、MDMAB157、MFM223和HCC38四个数据集的变异肽及其对应野生型肽信息,还提供已报道的癌症变异信息,支持蛋白质组学中变异肽的分析与研究。
文件详解
- 文件名称:
CusVarDB_extended_data.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含3个补充表格,具体内容如下:
- Supplementary Table 1:含BT474、MDMAB157、MFM223、HCC38数据集的变异肽、野生型肽,以及肽谱匹配(PSM)、蛋白质 accession、搜索交叉相关值(Xcorr)、保留时间(RT)等信息
- Supplementary Table 2:分表记录变异肽与对应野生型肽的完整信息,可通过列A(Sl.No)用Excel VLOOKUP函数映射关联
- Supplementary Table 3:简述已在其他癌症中报道过的变异信息
数据来源
CusVarDB研究项目
适用场景
- 蛋白质组学变异分析:用于研究BT474等数据集的变异肽与野生型肽的差异及特征
- 癌症变异研究:通过已报道的癌症变异信息,分析变异在不同癌症中的分布与关联
- 生物信息学工具验证:为CusVarDB工具构建定制化变异蛋白数据库的功能提供数据支持
- 质谱数据分析:利用PSM、Xcorr、RT等参数优化变异肽的质谱搜索与鉴定流程