数据集概述
本数据集为非洲加那利蓝山雀（Cyanistes teneriffae）亚种复合体的进化历史研究提供全基因组单核苷酸多态性（SNPs）数据，包含种群结构分析、系统发育重建及COI基因序列等相关文件，支持探究其种群分化、殖民事件及生殖性状差异等研究。
文件详解
- 种群结构分析文件
- 文件名称：Structure input data.txt、Structure input data (Libyan set).txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含用于种群结构分析的SNP基因型数据，示例内容为以个体标识开头的基因型编码序列（如0/1表示等位基因）
- 系统发育分析文件
- 文件名称：SNAPP_Libya.xml、SNAPP_2000SNPs.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：SNAPP（基于溯祖的系统发育分析工具）的输入配置文件，包含SNP数据路径、分析参数及树结构设置
- 基因序列文件
- 文件名称：COI.fas
- 文件格式：FAS（FASTA）
- 字段映射介绍：包含细胞色素c氧化酶亚基I（COI）基因的核苷酸序列数据
- 综合数据文件
- 文件名称：Dryad.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含数据集相关的补充信息，可能涉及样本元数据、分析结果汇总等结构化数据
数据来源
论文“The evolutionary history of Afrocanarian blue tits inferred from genome-wide SNPs”
适用场景
- 鸟类系统发育重建：基于全基因组SNPs数据构建非洲加那利蓝山雀的溯祖系统发育树，分析种群分化节点
- 种群结构分析：利用Structure输入数据探究非洲加那利蓝山雀的种群遗传结构及亚种单系性
- 殖民事件追溯：通过系统发育结果推断加那利群岛蓝山雀的多次独立殖民起源
- 生殖隔离研究：结合SNP数据与生殖性状（如精子长度）分析种群间生殖屏障形成机制
- 分类学修订支持：为非洲加那利蓝山雀亚种的物种地位划分提供基因组学证据
