数据集概述
本数据集包含海七鳃鳗感光细胞光谱敏感性及CYP27C1基因表达相关数据，用于研究脊椎动物通过CYP27C1酶将维生素A1转化为A2以调节感光受体敏感性的进化机制。数据涵盖微分光光度测量、定量PCR及光谱拟合分析结果，共14个文件，支持脊椎动物视觉可塑性的分子进化研究。
文件详解
- 数据文件（.dat格式，11个）
- 文件名称示例：Figure3C_SSC.dat、Figure2C_responseintensitycurves.dat
- 内容说明：包含感光细胞光谱敏感性（SSC）、响应强度曲线、微分光光度测量（MSP）等原始测量数据
- 定量PCR数据（.csv格式，1个）
- 文件名称：Lamprey_qPCR.csv
- 字段映射：Well（孔位）、Sample Name（样本名）、Dev Stage（发育阶段）、Target（靶基因）、CT值（循环阈值）、Tm（解链温度）等qPCR检测指标
- 说明文档（.txt格式，1个）
- 文件名称：README_for_Nanogram fitting.txt
- 内容说明：描述光谱拟合分析所用的R脚本、函数及数据说明
- 压缩包文件（.zip格式，1个）
- 文件名称：Nanogram fitting.zip
- 内容说明：包含光谱拟合分析相关的脚本和数据压缩包
数据来源
论文“Cambrian origin of the CYP27C1-mediated vitamin A1-to-A2 switch, a key mechanism of vertebrate sensory plasticity”
适用场景
- 脊椎动物视觉进化研究：分析CYP27C1介导维生素A转换机制的寒武纪起源及进化保守性
- 感光细胞光谱敏感性分析：通过微分光光度数据研究海七鳃鳗不同发育阶段感光细胞的光谱响应特性
- 基因表达调控研究：利用qPCR数据探究CYP27C1在视网膜色素上皮中的表达模式与视觉可塑性的关系
- 视觉色素光谱拟合建模：基于R脚本和光谱数据建立维生素A1/A2视蛋白色素的光谱吸收模型
- 无颌脊椎动物感官适应性研究：以海七鳃鳗为模型，分析水生环境光谱变化对脊椎动物视觉系统的适应性进化
