数据集概述
该数据集通过RNAscope结合免疫荧光技术，在单细胞分辨率下可视化不同条件下CYP3A4基因的mRNA与蛋白表达水平。包含HepaRG细胞分化四个时间点及五种处理条件的成像数据，为研究药物代谢相关基因表达调控提供支持。
文件详解
该数据集包含多个目录和TIFF格式图像文件，具体说明如下：
- 主目录: Jing manuscript original data_ Visualization of CY/
- 子目录结构:
- Figure 1 /: 含不同肝细胞模型（Huh7、HepG2、HepaRG）的成像数据
- Lower line Huh7/: 包含Tubulin.tif、Protein.tif、DAPI.tif、mRNA.tif、Merge zoom out.tif等图像文件
- Middle line HepG2/: 包含mRNA.tif、DAPI.tif、Merge zoom out.tif等图像文件
- Upper line HepaRG/: 包含Tubulin.tif、Protein.tif、DAPI.tif、mRNA.tif等图像文件
- Figure 2/: 含不同分化时间点（Day 7、14、21、28）的成像数据
- Figure 2A/至Figure 2F/: 每个子目录包含tubulin.tif、dapi.tif、3A4 mRNA.tif、3A4 protein.tif、merge.tif等文件
- Extra figures used for signal intensity counting/: 含信号强度定量分析相关图像
- Figure 3/: 按分化时间点（Day 7、14、21、28）分类的图像
- Figure 4/: 含Blank、Glucose处理条件的图像
- Figure 5/: 含FFA处理条件（500/1000 µM）的图像
- Figure 6/: 含Rifampicin处理条件的图像
- Figure 7/: 含APAP处理条件的图像
- 文件格式: 所有文件均为TIFF格式（.tif），记录细胞成像数据
适用场景
- 药物代谢研究: 分析CYP3A4基因在不同处理条件下的表达调控机制
- 细胞分化研究: 探究HepaRG细胞分化过程中CYP3A4的表达动态变化
- 单细胞分析: 研究单个细胞中mRNA与蛋白表达的异步性模式
- 毒理学研究: 评估药物（如APAP）对CYP3A4表达的影响
- 基因表达调控: 探索转录与翻译水平的协同与非协同表达关系
