数据集概述
本数据集聚焦巴哈马圣萨尔瓦多岛湖泊中鳉鱼适应性辐射过程中的生态物种形成，通过基因测序分析新生物种间的遗传分化模式。涵盖13,912个单核苷酸多态性位点数据，对比了刮鳞者、硬壳猎物 specialist（durophage）与广食性物种的遗传差异，探究不同营养生态位对物种形成进程的影响。
文件详解
- 压缩文件（Archive files）
- 文件名称：RaxML.zip、differentiation across lakes.zip、treemix.zip、SNP data.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：分别包含系统发育分析（RaxML）、湖泊间遗传分化、基因流分析（Treemix）及单核苷酸多态性（SNP）的原始或处理后数据
- 数据文件（Data files）
- 文件名称：Species and location for ID codes in all datasets.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含order（序号）、ID（样本编号）、species（物种名）、colors（颜色标记）、names（物种及产地）字段，记录样本的物种归属与地理信息
数据来源
论文“Novel trophic niches drive variable progress toward ecological speciation within an adaptive radiation of pupfishes”
适用场景
- 进化生态学研究: 分析适应性辐射过程中营养生态位对物种形成速率的影响机制
- 群体遗传学分析: 利用SNP数据探究鳉鱼种群的遗传分化、基因流及系统发育关系
- 生态位分化研究: 对比刮鳞者、durophage与广食性物种的遗传差异，揭示生态位特化的遗传基础
- 物种形成模型验证: 验证“同域物种形成伴随基因流”理论在适应性辐射中的适用性
- 生物地理学分析: 结合样本地理信息，研究岛屿湖泊系统中鳉鱼的分布格局与进化历史
