数据集概述
本数据集包含法国比利牛斯山脉蕨类植物×Cystocarpium roskamianum的分子数据,涉及距今约6000万年前分化的亲本谱系间的跨属杂交研究。数据涵盖年代分析、基因分型配置、后验分布拟合等相关文件,用于揭示蕨类植物生殖隔离机制演化及物种多样性形成机制,共12个文件。
文件详解
- 年代分析相关文件
- 文件名称:DatingAnalysis1_combnd_burninout.trees、DatingAnalysis2_run1of4.xml、DatingAnalysis1_run1of4.trees、DatingAnalysis1_run1of4.xml、DatingAnalysis2_run1of4.trees、DatingAnalysis2_combd_burninout.tre
- 文件格式:.trees、.xml、.tre
- 字段映射介绍:包含系统发育年代分析的树结构文件(.trees、.tre)、分析配置文件(.xml),记录亲本谱系分化时间及杂交事件的分子钟估算信息
- 日志文件
- 文件名称:DatingAnalysis2_run1of4.log、DatingAnalysis2_combnd_burninout.log、DatingAnalysis1_run1of4.log
- 文件格式:.log
- 字段映射介绍:记录年代分析过程中的参数输出、运行状态及统计信息
- 基因分型配置文件
- 文件名称:xCysto_alleles_garli.conf
- 文件格式:.conf
- 字段映射介绍:包含蕨类植物等位基因分型的分析参数配置
- 后验分布拟合代码文件
- 文件名称:xCysto_posterior_distributions_fitting_etc.R
- 文件格式:.R
- 字段映射介绍:用于后验分布拟合及相关统计分析的R语言代码
适用场景
- 植物跨属杂交机制研究: 分析蕨类植物极端深度杂交事件的分子基础及生殖隔离演化规律
- 物种分化时间估算: 利用年代分析文件研究蕨类植物亲本谱系的分化时间及杂交事件发生节点
- 生殖隔离演化速率分析: 对比蕨类与被子植物的生殖隔离机制,探讨非生物介导受精植物的"物种形成时钟"特性
- 生物多样性形成机制研究: 为解释蕨类物种多样性低于被子植物的现象提供分子证据支持