数据集概述
本数据集是BinaryClust2管道的测试数据,包含11例骨髓增殖性肿瘤(MPN)患者的外周血单个核细胞(PBMC)样本。样本通过36标记面板的质谱流式细胞术(CyTOF)获取,用于免疫监测研究。数据集包含清理后的FCS原始数据、样本元数据、面板元数据及预定义的R对象文件,共16个文件。
文件详解
- 原始数据文件
- 文件名称:SBB_JAK2.fcs、CJ_JAK2.fcs、PC_JAK2.fcs、JB_Non_JAK2.fcs、KA_JAK2.fcs、AM_Non_JAK2.fcs、JY_JAK2.fcs、LDD_Non_JAK2.fcs等(共11个.fcs文件)
- 文件格式:FCS
- 字段映射介绍:清理后的PBMC样本质谱流式原始数据,包含细胞标记物的表达信息
- 元数据文件
- 文件名称:metadata2.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:样本元数据,记录MPN患者样本的基本信息
- 文件名称:panel_metadata2.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:面板元数据,描述36标记面板的相关信息
- R对象文件
- 文件名称:panel.RData、md.RData、MPN_sce.RData
- 文件格式:RData
- 字段映射介绍:预定义的R对象,包含面板信息、元数据及样本表达矩阵等结构化数据
数据来源
BinaryClust2项目(https://github.com/JingAnyaSun/BinaryClust2)
适用场景
- 免疫监测研究:分析MPN患者PBMC样本的免疫细胞亚群及标记物表达特征
- 流式数据分析工具测试:用于BinaryClust2管道的功能验证与性能测试
- 肿瘤免疫研究:探索骨髓增殖性肿瘤患者的免疫状态与疾病关联
- 质谱流式数据处理:作为CyTOF数据标准化、聚类分析的测试案例