数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了DA609品系(基因型npr-1(ad609)X)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM培养基上开展,通过视频跟踪获取线虫运动特征,包含原始行为记录及特征提取结果,支持线虫神经行为表型分析。
文件详解
- 行为原始数据文件:npr-1 (ad609)X on food L_2010_01_25__16_09_32810.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含线虫行为原始记录数据,遵循wcon格式标准,记录线虫运动轨迹的时序信息
- 特征提取结果文件:npr-1 (ad609)X on food L_2010_01_25__16_09_32810_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动轨迹、身体姿态、速度等量化指标
- 实验主数据文件:npr-1 (ad609)X on food L_2010_01_25__16_09_32810.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验元数据(如时间戳、采样频率、像素分辨率)及线虫骨架分割数据(共4115个分割骨架)
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫神经行为表型研究:分析npr-1基因变异对秀丽隐杆线虫摄食、运动等行为的影响
- 神经遗传学机制探索:结合基因型数据,研究G蛋白偶联受体(npr-1编码)调控线虫社会行为的分子机制
- 行为分析算法验证:利用标注的行为数据,测试或优化线虫行为跟踪与特征提取算法
- 模式生物标准化实验参考:为秀丽隐杆线虫行为学实验提供标准化方法及数据格式参考