Danaus_plexippus_Orthofinder_Based_帝王蝶基因组注释及同源关系分析结果数据

数据集概述

本数据集包含Danaus plexippus(帝王蝶)的基因组注释结果及Orthofinder同源关系分析数据。通过Funannotate、Augustus等工具完成基因模型预测与功能注释,结合PASA、BRAKER等流程优化注释结果;同时使用Orthofinder分析该物种与其他7种昆虫的蛋白编码基因同源关系,为基因组学研究提供结构化数据支持。

文件详解

  • 文件名称:Dpv4_Orthofinder.zip
  • 文件格式:ZIP(压缩包)
  • 字段映射介绍:压缩包内包含帝王蝶基因组注释的核心结果(如基因模型、功能注释信息)及Orthofinder分析输出(如同源基因簇、物种间同源关系矩阵等);具体字段需解压后查看原始文件,推测包含基因ID、注释类型、同源基因ID、物种分类等信息。

适用场景

  • 基因组注释验证: 用于评估帝王蝶基因组注释流程的准确性,对比不同工具(Augustus、GeneMark-ET)的基因预测结果差异。
  • 昆虫进化研究: 利用Orthofinder结果分析帝王蝶与其他昆虫(如Bombyx mori、Drosophila melanogaster)的基因同源关系,探究物种进化历程。
  • 功能基因组学分析: 基于注释的基因模型,研究帝王蝶特定基因(如非编码RNA、蛋白编码基因)的功能与表达模式。
  • 比较基因组学研究: 整合多物种同源基因数据,开展昆虫基因组的共线性、基因家族扩张/收缩分析。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 5.72 MiB
最后更新 2025年12月29日
创建于 2025年12月29日
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