数据集概述
本数据集包含Danaus plexippus(帝王蝶)的基因组注释结果及Orthofinder同源关系分析数据。通过Funannotate、Augustus等工具完成基因模型预测与功能注释,结合PASA、BRAKER等流程优化注释结果;同时使用Orthofinder分析该物种与其他7种昆虫的蛋白编码基因同源关系,为基因组学研究提供结构化数据支持。
文件详解
- 文件名称:
Dpv4_Orthofinder.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 字段映射介绍:压缩包内包含帝王蝶基因组注释的核心结果(如基因模型、功能注释信息)及Orthofinder分析输出(如同源基因簇、物种间同源关系矩阵等);具体字段需解压后查看原始文件,推测包含基因ID、注释类型、同源基因ID、物种分类等信息。
适用场景
- 基因组注释验证: 用于评估帝王蝶基因组注释流程的准确性,对比不同工具(Augustus、GeneMark-ET)的基因预测结果差异。
- 昆虫进化研究: 利用Orthofinder结果分析帝王蝶与其他昆虫(如Bombyx mori、Drosophila melanogaster)的基因同源关系,探究物种进化历程。
- 功能基因组学分析: 基于注释的基因模型,研究帝王蝶特定基因(如非编码RNA、蛋白编码基因)的功能与表达模式。
- 比较基因组学研究: 整合多物种同源基因数据,开展昆虫基因组的共线性、基因家族扩张/收缩分析。