蛋白质结构预测数据集KG-TrainPDBs-ivanblch
数据来源:互联网公开数据
标签:蛋白质结构,蛋白质数据库,数据集,生物信息学,分子生物学,结构预测,机器学习,蛋白质折叠
数据概述:该数据集包含来自蛋白质数据库(PDB)的蛋白质结构数据,主要用于蛋白质结构预测和相关研究。主要特征如下:
时间跨度:数据记录的时间范围取决于PDB数据库的更新,通常涵盖了从早期到现在的蛋白质结构信息。
地理范围:数据覆盖全球范围内的蛋白质结构信息,不依赖于特定地理区域。
数据维度:数据集包括蛋白质的氨基酸序列、三维结构坐标(原子坐标)、实验数据(如分辨率、R因子等)以及蛋白质的注释信息。
数据格式:数据通常以PDB格式提供,也可能包含其他相关数据格式,如FASTA(氨基酸序列)和CIF(结构文件)。
来源信息:数据来源于蛋白质数据库(PDB),这是一个由世界各地的研究人员贡献和维护的公开数据库,数据已进行标准化和结构化。
该数据集适合用于生物信息学、蛋白质结构预测、机器学习等领域的研究和应用,尤其是在开发和评估蛋白质结构预测算法、研究蛋白质功能和相互作用等方面具有重要价值。
数据用途概述:该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于蛋白质结构预测、蛋白质折叠、蛋白质-蛋白质相互作用等生物学研究,如蛋白质结构比对、结构域分析等。
行业应用:可以为药物研发、生物技术等行业提供数据支持,特别是在靶标识别、药物设计等方面。
决策支持:支持蛋白质结构分析和预测,帮助研究人员更好地理解蛋白质的结构和功能,从而加速新药研发和生物技术创新。
教育和培训:作为生物信息学、分子生物学等课程的辅助材料,帮助学生和研究人员深入理解蛋白质结构和功能。
此数据集特别适合用于探索蛋白质结构和功能之间的关系,帮助用户实现蛋白质结构预测、蛋白质结构分析等目标,为生物医药研究和产业发展提供数据支持。