蛋白质序列-肽段-标签分类数据集ProteinSequence-Peptide-LabelClassificationDataset-sshahraki96
数据来源:互联网公开数据
标签:蛋白质, 肽段, 序列, 机器学习, 生物信息学, 蛋白质组学, 序列比对, 深度学习
数据概述:
该数据集包含来源于蛋白质序列和肽段相关数据,主要用于蛋白质序列与肽段的分类任务。主要特征如下:
时间跨度:数据未明确标注时间,可视为静态数据集。
地理范围:数据未限定具体地理范围,主要关注蛋白质序列与肽段的生物学特性。
数据维度:数据集包含多种数据文件,核心数据项包括:蛋白质ID(prot_id)、蛋白质位点(prot_site)、蛋白质嵌入向量(prot_embedding)、分类标签(label)、肽段序列(peptide)以及蛋白质全长序列。
数据格式:主要为CSV格式,便于数据分析和模型构建。数据集分为训练集(train_data.csv, Protein-seq-peptide-train (1).csv, full_sequences_train (1).csv)和测试集(test_data.csv, Protein-seq-peptide-test (1).csv, full_sequences_test (1).csv),并包含中间处理数据和模型代码。
来源信息:数据来源未明确,但数据集结构表明可能来自生物信息学或机器学习领域的研究项目。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于蛋白质结构与功能、肽段识别、蛋白质组学等相关领域的学术研究,如蛋白质相互作用预测、蛋白质序列分类等。
行业应用:可为生物制药、生物技术公司提供数据支持,用于药物靶点发现、蛋白质工程、疾病诊断等。
决策支持:支持生物信息学研究人员和生物技术公司进行数据驱动的决策,优化实验设计和提高研究效率。
教育和培训:作为生物信息学、机器学习、蛋白质组学等课程的实训材料,帮助学生和研究人员理解蛋白质序列分析和分类方法。
此数据集特别适合用于探索蛋白质序列与肽段的关联关系,构建蛋白质分类模型,预测蛋白质功能,并应用于药物研发和生物技术领域。