单细胞药物扰动实验结果与模型训练数据集

单细胞药物扰动实验结果与模型训练数据集_Single_cell_Drug_Perturbation_Experiment_and_Model_Training_Dataset

数据来源:互联网公开数据

标签:单细胞测序, 药物扰动, 细胞嵌入, 深度学习, 模型训练, 生物信息学, 基因表达, 药物反应

数据概述: 该数据集包含来自单细胞药物扰动实验的数据,记录了细胞在不同药物处理下的基因表达变化情况,以及用于训练深度学习模型的数据。主要特征如下: 时间跨度:数据未明确标注时间,可视为一次实验的静态快照。 地理范围:数据源于特定生物医学研究,未限定地理范围。 数据维度:数据集包含多种类型的数据,包括: adata_train_pp.h5ad: 预处理后的训练数据,用于模型训练。 cpa_pert_cell_embeddings.h5ad:细胞嵌入数据,用于分析细胞对药物的反应。 cpa_pert_embeddings.h5ad:药物扰动嵌入数据,用于分析药物对细胞的影响。 CPA_info.json:实验相关信息,可能包含药物、细胞类型等元数据。 history.csv:模型训练过程中的历史记录,包括损失函数、评估指标等。 model.pt:训练好的深度学习模型。 数据格式:数据以多种格式提供,包括H5AD、JSON、PT和CSV,便于数据分析和模型构建。 来源信息:数据来源于生物医学研究,已进行预处理和模型训练,方便用户直接使用。 该数据集适合用于单细胞生物学研究、药物发现、个性化医疗等领域。

数据用途概述: 该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景: 研究与分析:适用于单细胞生物学、药物基因组学等领域的学术研究,如药物作用机制分析、细胞状态预测等。 行业应用:为生物制药、医疗诊断等行业提供数据支持,特别是在药物筛选、靶点发现、疗效预测等方面。 决策支持:支持药物研发过程中的决策制定,加速新药的发现与验证。 教育和培训:作为生物信息学、机器学习课程的实训材料,帮助学生和研究人员深入理解单细胞数据分析和深度学习模型构建。 此数据集特别适合用于探索药物对细胞的影响规律,构建预测细胞对不同药物反应的模型,从而加速药物研发进程,推动精准医疗的发展。

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数据与资源

附加信息

字段
版本 1.0
数据集大小 726.63 MiB
最后更新 2025年11月26日
创建于 2025年11月26日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。