数据集概述
本数据集通过分析沉积物卵库中的休眠卵遗传信息,重建了1970年代Daphnia pulicaria入侵康斯坦茨湖的种群遗传动态,包括入侵源识别、遗传变异变化及繁殖方式转变等核心内容,为入侵生物学研究提供关键遗传数据支持。
文件详解
- 说明文件
- 文件名称:README_for_Data files and R codes.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含缩略词说明(如MW代表Markelfinger Winkel、GS代表Gnadensee)、输入文件清单及用途说明,涉及微卫星基因型、沉积物层与年代、序列比对、系统发育树、STRUCTURE分析文件等类别
- 数据与代码压缩包
- 文件名称:Data files and R codes.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含微卫星基因型文件(MWGS_genetix_periods.txt等)、沉积物层信息文件(MWGS_layerinfo.txt)、序列比对文件(ND5_alignment.fas等)、系统发育树文件(ND5_tree.mts等)、STRUCTURE分析输入文件等核心数据及分析代码
数据来源
论文“Population genetic dynamics of an invasion reconstructed from the sediment egg bank”
适用场景
- 入侵种群遗传动态研究:分析Daphnia pulicaria入侵过程中遗传变异的时间变化规律
- 入侵源识别与溯源:通过遗传数据确定入侵种群的起源地及扩散路径
- 繁殖策略进化分析:研究入侵初期自交/近交向低自交率转变的繁殖策略动态
- 沉积物卵库遗传信息利用:探索休眠卵库在保存入侵历史遗传信息中的应用价值
- 入侵生物学方法论验证:验证结合历史信息与卵库遗传分析重建入侵过程的研究方法