数据集概述
本数据集围绕奶牛瘤胃微生物群落非侵入性样本替代评估展开，包含瘤胃瘘管直接获取的瘤胃食糜、口腔液、反刍食糜（食团）及粪便样本的微生物群落分析数据。通过5×5拉丁方设计，对五头奶牛在不同脂质补充剂处理下的样本进行qPCR及16S、18S rRNA基因和真菌ITS1扩增子测序，比较不同样本类型与瘤胃食糜的微生物群落差异。
文件详解
- 序列元数据文件
- 文件名称：Sequence metadata.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含样本的基本元数据信息，支持测序数据的关联分析
- 真菌数据压缩包
- 文件名称：fungi.tar.gz
- 文件格式：GZ压缩包
- 字段映射介绍：存储真菌ITS1扩增子测序相关数据
- 细菌数据压缩包
- 文件名称：bacteria.tar.gz
- 文件格式：GZ压缩包
- 字段映射介绍：存储细菌16S rRNA基因测序相关数据
- 古菌数据压缩包
- 文件名称：archaea.tar.gz
- 文件格式：GZ压缩包
- 字段映射介绍：存储古菌16S rRNA基因测序相关数据
- 原生动物数据压缩包
- 文件名称：protozoa.tar.gz
- 文件格式：GZ压缩包
- 字段映射介绍：存储原生动物18S rRNA基因测序相关数据
适用场景
- 瘤胃微生物研究方法优化: 评估口腔液、反刍食糜等非侵入性样本作为瘤胃食糜替代物的可行性
- 奶牛瘤胃微生物群落分析: 研究不同脂质补充剂对奶牛瘤胃细菌、真菌、古菌及原生动物群落的影响
- 畜牧生产环境足迹优化: 为筛选低环境足迹奶牛的育种计划提供瘤胃微生物表型的非侵入性采样方案支持
- 反刍动物营养调控研究: 分析饲料脂质补充剂与瘤胃微生物群落结构的关联，指导精准营养策略制定
