数据集概述
本数据集包含论文《Age truncation due to disease shrinks metapopulation viability for amphibians》的全部CSV数据文件、GRD景观栅格文件及配套R分析代码，覆盖Bd疾病前后两栖动物年龄结构分析、景观栅格生成、集合种群动态模拟及结果分析等全流程内容，可支持论文所有分析的复现。
文件详解
- 数据文件
- CSV文件（共13个）：包含年龄结构数据（Age_structure_data.csv）、连通性后验样本（connectivity_posterior_samples.csv）、生存系数后验样本（survival_cv_posterior_samples.csv）、历史/当代集合种群模拟结果（sim_results_Laur_historical_metapop_compiled.csv等）、多元正态超体积后验数据（posterior_draws_mvnh.csv）等，记录物种存活状态、场景类型、迭代参数、连通性数值等字段
- GRD/GRI文件：sample_landscapes.grd、sample_landscapes.gri，为景观栅格数据
- XML文件：sample_landscapes.grd.aux.xml，为栅格辅助元数据
- 代码文件（共7个R脚本）
- Age_structure_analysis.R：Bd疾病前后种群年龄结构回归建模及基于“捕获曲线”的成体存活率估算
- Derive_landscape_rasters.R：生成Bd疾病前后集合种群动态模拟用样本景观栅格
- STEPS_model.R：基于STEPS包的集合种群动态模拟函数
- Run_STEPS_simulations.R：跨所有 demographic 和连通性场景运行集合种群模拟
- Metapop_sims_analysis_GLM.R：对模拟结果（灭绝/存续）拟合逻辑回归模型
- Metapop_sims_analysis_MVNH.R：对模拟结果拟合多元正态超体积
- Generate_figures.R：生成论文所有图表及表2
数据来源
论文“Heard, G.W., Scroggie, M.P., Hollanders, M., and Scheele, B.C. (in press). Age truncation due to disease shrinks metapopulation viability for amphibians. Journal of Applied Ecology.”
适用场景
- 两栖动物种群生态学研究：分析Bd疾病导致的年龄截断对种群年龄结构及成体存活率的影响
- 集合种群生存力评估：模拟不同疾病场景下两栖动物集合种群的存续概率与动态变化
- 景观连通性生态效应分析：探究景观栅格特征对集合种群连通性及生存力的作用机制
- 疾病驱动种群衰退机制研究：揭示疾病通过年龄结构改变影响种群长期存续的内在过程
- 生态保护策略制定：基于模拟结果为受Bd威胁的两栖动物种群保护提供科学依据
