数据集概述
本数据集为死亡谷魔洞鳉鱼(Cyprinodon diabolis)生存研究相关的基因组数据,包含系统发育分析、SNP矩阵及种群动态分析文件。该物种是濒危脊椎动物,生存于极端环境中,研究通过基因组方法揭示其种群历史、基因流动及遗传同化过程,为濒危物种保护提供新视角。
文件详解
- 系统发育分析文件包
- 文件名称:phylogenetic analyses.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 字段映射介绍:包含用于魔洞鳉鱼及其近缘种系统发育关系推断的相关数据文件
- SNP矩阵文件包
- 文件名称:SNP matrices.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 字段映射介绍:包含超过13,000个基因座的单核苷酸多态性(SNP)数据矩阵
- 种群动态分析文件包
- 文件名称:dadi files for demographic analysis.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 字段映射介绍:包含用于dadi软件进行种群历史动态模拟分析的输入文件
适用场景
- 濒危物种种群遗传学研究: 分析魔洞鳉鱼的种群历史、基因流动模式及遗传分化过程
- 极端环境适应性进化研究: 探讨魔洞鳉鱼在死亡谷极端环境中的适应性进化机制
- 物种保护策略制定: 基于种群基因组数据为濒危魔洞鳉鱼的保护管理提供科学依据
- 快速进化物种形成时间尺度研究: 验证快速进化物种的物种形成时间尺度是否被普遍高估
- 基因同化现象研究: 分析魔洞鳉鱼盆鳍丢失等性状的基因同化过程及机制