数据集概述
本数据集包含金黄色葡萄球菌(S. aureus)、大肠杆菌(E. coli)和枯草芽孢杆菌(B. subtilis)的混合训练与测试图像,以及用于细胞分割的StarDist模型。图像类型涵盖明场、荧光和分割掩膜,适用于微生物细胞图像分割的模型训练与验证。
文件详解
- 文件名称:DeepBacs_Model_Segmentation_StarDist_MIXED_dataset.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含训练好的StarDist 2D模型文件,可用于ZeroCostDL4Mic StarDist 2D笔记本、StarDist Fiji插件或TrackMate Fiji插件(v7+)。
- 文件名称:DeepBacs_Data_Segmentation_StarDist_MIXED_dataset.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含三种细菌的混合训练与测试图像,图像格式为.tif(8位和16位),涵盖明场、荧光和分割掩膜图像。
数据来源
GitHub wiki(Additional information can be found on this github wiki)
适用场景
- 微生物细胞图像分割研究: 用于训练和测试细菌细胞分割模型,提升分割精度。
- 计算机视觉模型开发: 为StarDist等细胞分割模型提供多样化的训练数据,优化模型性能。
- 微生物学研究: 辅助分析不同细菌的形态特征与生长状态。
- 医学与生物学图像分析: 支持细菌细胞图像的自动化处理与定量分析。