数据集概述
本数据集包含DFMO处理与未处理的尤文肉瘤PDX模型的RNA-seq数据，用于研究多胺耗竭通过诱导铁死亡抑制肿瘤转移的机制。数据经Salmon比对至人鼠联合参考转录组，主要分析保留人类基因比对结果，包含元数据文件与量化表达谱压缩包。
文件详解
- meta_tab.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含样本ID映射实验条件的元数据，字段有sequence_id（测序ID）、PDX_id（PDX模型ID）、treated（处理组：control为未处理）、gender（性别）、days（处理天数）、type（样本类型）
- salmon_quant.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 内容说明：Salmon量化的基因表达谱，基于人鼠联合参考转录组比对结果，主要分析保留人类基因的表达数据
数据来源
论文“Polyamine Depletion by D, L-alpha-difluoromethylornithine Inhibits Ewing Sarcoma Metastasis by Inducing Ferroptosis”
适用场景
- 肿瘤代谢机制研究：分析多胺耗竭对尤文肉瘤基因表达的影响，探究铁死亡诱导通路
- 转移抑制靶点验证：验证DFMO通过多胺代谢抑制尤文肉瘤转移的分子机制
- 转录组差异表达分析：比较DFMO处理与未处理组的基因表达谱，筛选铁死亡相关差异基因
- 肿瘤治疗靶点开发：基于数据挖掘尤文肉瘤转移相关的潜在治疗靶点，为临床转化提供依据
