数据集概述
本数据集包含用于五分类群对称系统发育中基因渐渗检测的DFOIL方法相关文件,包括检测工具代码、模拟脚本、说明文档及示例数据,支持基因渐渗事件的供体与受体谱系识别,适用于系统发育基因组数据分析。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称:README_for_dfoil.md
- 文件格式:MD
- 字段映射介绍:包含DFOIL工具的作者、引用信息、版本历史、运行依赖等说明内容
- 代码文件
- 文件名称:dfoil_analyze.py、dfoil.py、dfoil_sim.py
- 文件格式:PY
- 字段映射介绍:DFOIL方法的核心实现代码,分别用于数据分析、主检测流程及模拟实验
- 存档文件
- 文件名称:sample_data.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含DFOIL方法的示例数据,用于工具测试与验证
数据来源
Dryad数据平台(2015年4月15日发布版本)
适用场景
- 系统发育基因渐渗分析: 检测五分类群系统发育中的基因渐渗事件,识别供体与受体谱系
- 基因组数据演化研究: 分析基因组范围内的基因渐渗模式及时空分布
- 系统发育方法验证: 通过模拟数据评估DFOIL方法在低渐渗率下的准确性与假阳性率
- 演化生物学工具开发: 基于DFOIL代码框架扩展复杂系统发育的基因渐渗检测功能