数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)DH244菌株(携带zyg-9(b244)II基因突变)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的运动行为特征,包含视频跟踪生成的骨架数据、行为特征数据及标准化格式文件,可用于研究该基因突变对虫体行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件(Scientific files)
- 文件名称:zyg-9 (b244)II on food R_2012_03_15__09_36_5751.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验基本信息、视频元数据及26175个分段骨架数据,记录线虫运动的空间结构特征
- 文件名称:zyg-9 (b244)II on food R_2012_03_15__09_36_5751_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,涵盖运动轨迹、速度、体态等量化指标
- 归档文件(Archive files)
- 文件名称:zyg-9 (b244)II on food R_2012_03_15__09_36_5751.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含wcon格式的标准化行为数据,可用于跨平台的线虫行为数据交换与整合
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究: 分析zyg-9(b244)基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 模式生物行为学分析: 基于骨架数据和行为特征,研究线虫在食物环境中的运动模式、速度及体态变化
- 实验方法验证: 参考E. Yemini等人的实验方法,开展同类线虫行为实验的方法学验证
- 行为数据标准化研究: 利用wcon格式文件,探索模式生物行为数据的标准化存储与共享规范